Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnpo3Q6P2B1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnpo3Q6P2B1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo3Q6P2B1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnpo3Q6P2B1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo3Q6P2B1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo3Q6P2B1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo3Q6P2B1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms