Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc8Q6NZB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc8Q6NZB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc8Q6NZB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc8Q6NZB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc8Q6NZB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms