Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SphkapQ6NSW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SphkapQ6NSW3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SphkapQ6NSW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SphkapQ6NSW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SphkapQ6NSW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SphkapQ6NSW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SphkapQ6NSW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SphkapQ6NSW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SphkapQ6NSW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
SphkapQ6NSW3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SphkapQ6NSW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SphkapQ6NSW3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SphkapQ6NSW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SphkapQ6NSW3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SphkapQ6NSW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SphkapQ6NSW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SphkapQ6NSW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SphkapQ6NSW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SphkapQ6NSW3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms