Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retreg2Q6NS82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retreg2Q6NS82 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retreg2Q6NS82 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retreg2Q6NS82 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retreg2Q6NS82 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retreg2Q6NS82 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms