Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Pdcd11Q6NS46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pdcd11Q6NS46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pdcd11Q6NS46 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pdcd11Q6NS46 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pdcd11Q6NS46 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pdcd11Q6NS46 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pdcd11Q6NS46 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pdcd11Q6NS46 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pdcd11Q6NS46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pdcd11Q6NS46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pdcd11Q6NS46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pdcd11Q6NS46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pdcd11Q6NS46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pdcd11Q6NS46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pdcd11Q6NS46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pdcd11Q6NS46 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pdcd11Q6NS46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pdcd11Q6NS46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pdcd11Q6NS46 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pdcd11Q6NS46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms