Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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