Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt77Q6IFZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt77Q6IFZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt77Q6IFZ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt77Q6IFZ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt77Q6IFZ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt77Q6IFZ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt77Q6IFZ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt77Q6IFZ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms