Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rftn1Q6A0D4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rftn1Q6A0D4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rftn1Q6A0D4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rftn1Q6A0D4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rftn1Q6A0D4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rftn1Q6A0D4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rftn1Q6A0D4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,3 ms