Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4bp1Q6A037 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4bp1Q6A037 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp1Q6A037 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4bp1Q6A037 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp1Q6A037 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms