Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CilpQ66K08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CilpQ66K08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CilpQ66K08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CilpQ66K08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CilpQ66K08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CilpQ66K08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CilpQ66K08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms