Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Top2bQ64511 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Top2bQ64511 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Top2bQ64511 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
Top2bQ64511 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Top2bQ64511 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Top2bQ64511 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Top2bQ64511 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Top2bQ64511 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Top2bQ64511 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Top2bQ64511 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Top2bQ64511 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
Top2bQ64511 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Top2bQ64511 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Top2bQ64511 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Top2bQ64511 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Top2bQ64511 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Top2bQ64511 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Top2bQ64511 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Top2bQ64511 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Top2bQ64511 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Top2bQ64511 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Top2bQ64511 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Top2bQ64511 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms