Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ca4Q64444 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ca4Q64444 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca4Q64444 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca4Q64444 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca4Q64444 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ca4Q64444 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca4Q64444 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ca4Q64444 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca4Q64444 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms