Protein–RNA interactions for Protein: Q64249

Nr6a1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr6a1Q64249 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr6a1Q64249 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr6a1Q64249 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr6a1Q64249 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr6a1Q64249 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr6a1Q64249 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr6a1Q64249 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms