Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4cQ64151 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4cQ64151 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4cQ64151 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema4cQ64151 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4cQ64151 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4cQ64151 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4cQ64151 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4cQ64151 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4cQ64151 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4cQ64151 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms