Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab34Q64008 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab34Q64008 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab34Q64008 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab34Q64008 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab34Q64008 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab34Q64008 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab34Q64008 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab34Q64008 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms