Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CcncQ62447 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CcncQ62447 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CcncQ62447 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CcncQ62447 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcncQ62447 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcncQ62447 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CcncQ62447 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcncQ62447 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcncQ62447 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CcncQ62447 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcncQ62447 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CcncQ62447 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcncQ62447 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcncQ62447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcncQ62447 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcncQ62447 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcncQ62447 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CcncQ62447 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms