Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Scn9aQ62205 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scn9aQ62205 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scn9aQ62205 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Scn9aQ62205 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Scn9aQ62205 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Scn9aQ62205 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Scn9aQ62205 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Scn9aQ62205 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Scn9aQ62205 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Scn9aQ62205 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,9 ms