Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema4bQ62179 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema4bQ62179 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema4bQ62179 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4bQ62179 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4bQ62179 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema4bQ62179 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms