Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd53Q61451 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd53Q61451 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd53Q61451 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd53Q61451 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms