Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gata6Q61169 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gata6Q61169 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata6Q61169 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata6Q61169 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gata6Q61169 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms