Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamb3Q61087 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lamb3Q61087 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lamb3Q61087 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamb3Q61087 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamb3Q61087 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lamb3Q61087 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms