Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Laptm4aQ60961 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Laptm4aQ60961 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Laptm4aQ60961 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Laptm4aQ60961 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Laptm4aQ60961 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms