Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tbc1d1Q60949 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tbc1d1Q60949 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tbc1d1Q60949 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d1Q60949 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d1Q60949 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d1Q60949 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d1Q60949 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms