Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf15Q5UBV8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms