Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav3-3Q5R1C3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trav3-3Q5R1C3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav3-3Q5R1C3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav3-3Q5R1C3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms