Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5431Q5NCB3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5431Q5NCB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5431Q5NCB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5431Q5NCB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5431Q5NCB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5431Q5NCB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5431Q5NCB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5431Q5NCB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5431Q5NCB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms