Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynaQ5G5D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynaQ5G5D5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SynaQ5G5D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SynaQ5G5D5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SynaQ5G5D5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SynaQ5G5D5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms