Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms