Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
L1td1Q587J6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1td1Q587J6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1td1Q587J6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
L1td1Q587J6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1td1Q587J6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1td1Q587J6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms