Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1qtnf9Q4ZJN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1qtnf9Q4ZJN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1qtnf9Q4ZJN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms