Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub2Q3V209 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub2Q3V209 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmub2Q3V209 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmub2Q3V209 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmub2Q3V209 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmub2Q3V209 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms