Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H3

Hephl1, Hephaestin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hephl1Q3V1H3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hephl1Q3V1H3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hephl1Q3V1H3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hephl1Q3V1H3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hephl1Q3V1H3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hephl1Q3V1H3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms