Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3V0E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3V0E1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3V0E1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3V0E1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3V0E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3V0E1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3V0E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Q3V0E1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3V0E1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3V0E1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3V0E1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3V0E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3V0E1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3V0E1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms