Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp48Q3V0C5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp48Q3V0C5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp48Q3V0C5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp48Q3V0C5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Usp48Q3V0C5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp48Q3V0C5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp48Q3V0C5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp48Q3V0C5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp48Q3V0C5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp48Q3V0C5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp48Q3V0C5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp48Q3V0C5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp48Q3V0C5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms