Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc9Q3V038 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc9Q3V038 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc9Q3V038 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc9Q3V038 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9Q3V038 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc9Q3V038 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc9Q3V038 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc9Q3V038 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc9Q3V038 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms