Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed1Q3V009 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed1Q3V009 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed1Q3V009 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed1Q3V009 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed1Q3V009 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed1Q3V009 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms