Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc114Q3UX62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc114Q3UX62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc114Q3UX62 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc114Q3UX62 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc114Q3UX62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms