Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Skap1Q3UUV5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Skap1Q3UUV5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Skap1Q3UUV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Skap1Q3UUV5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Skap1Q3UUV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap1Q3UUV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms