Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thsd4Q3UTY6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thsd4Q3UTY6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thsd4Q3UTY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thsd4Q3UTY6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thsd4Q3UTY6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thsd4Q3UTY6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms