Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BB287469Q3UT53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BB287469Q3UT53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BB287469Q3UT53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BB287469Q3UT53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BB287469Q3UT53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms