Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D13Ertd608eQ3UPR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms