Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog7Q3UM29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog7Q3UM29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog7Q3UM29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog7Q3UM29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog7Q3UM29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms