Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CrxosQ3UL53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrxosQ3UL53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrxosQ3UL53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CrxosQ3UL53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrxosQ3UL53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms