Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A930003A15RikQ3U552 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A930003A15RikQ3U552 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A930003A15RikQ3U552 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A930003A15RikQ3U552 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms