Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KcpQ3U492 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KcpQ3U492 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KcpQ3U492 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KcpQ3U492 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KcpQ3U492 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KcpQ3U492 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KcpQ3U492 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KcpQ3U492 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KcpQ3U492 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KcpQ3U492 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KcpQ3U492 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms