Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gse1Q3U3C9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gse1Q3U3C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gse1Q3U3C9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gse1Q3U3C9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gse1Q3U3C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gse1Q3U3C9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms