Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hhla1Q3TYV2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hhla1Q3TYV2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hhla1Q3TYV2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hhla1Q3TYV2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hhla1Q3TYV2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hhla1Q3TYV2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hhla1Q3TYV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hhla1Q3TYV2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms