Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XylbQ3TNA1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XylbQ3TNA1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XylbQ3TNA1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
XylbQ3TNA1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XylbQ3TNA1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms