Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NrepQ07475 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NrepQ07475 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrepQ07475 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrepQ07475 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NrepQ07475 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrepQ07475 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrepQ07475 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NrepQ07475 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NrepQ07475 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NrepQ07475 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrepQ07475 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms