Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf4Q06507 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf4Q06507 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atf4Q06507 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf4Q06507 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf4Q06507 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf4Q06507 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms